有关加氢站的基础设施建设和燃料电池的安全性问题成为横跨在这类新能源车型市场拓展的最大障碍。
氢气是一种易燃易爆的气体，因此以氢气为动力的车型的安全性是一个不可回避的问题。由于氢气的密度非常小，因此在储藏的时候需要使用高压气罐，为了保证超过700个大气压的压力罐的安全，储氢罐采用铝合金外壳，并在外围包裹一层碳纤维强化塑料的保护壳，以保证罐体的刚性和防碰撞能力。
加氢站加氢的方式，主要有两种：一种是先将氢气装载入气罐中，再将氢气罐运输至加氢站。由于车辆的行驶会造成静电，氢气容易发生爆炸。在中国特殊的国情下，相关部门对于安全问题的监管普遍不够到位，加氢站存在巨大的安全隐患，引起了业内人士的担忧。
出于安全的考虑，加氢站很有可能只会建在远离居民区且较为空旷的地带，这也意味着城市里的消费者必须要行驶很长一段距离才能加氢，消费者是否能够容忍这样的不便，也存在很大疑问。
另一种加氢的方式则是现场制备氢气，但这种模式也存在天生的短板。如果在车上使用制氢的燃料电池，必须使用催化剂，目前成熟有效的催化剂均少不了贵金属铂(Pt)，或者铂和钌(Ru)的合金。但可惜的是，地球上铂或者钌的含量极为有限，根本无法满足氢燃料车的商业化生产。
除非能找到新的快速制氢的方法，否则现场制备氢气的模式是完全不可行的。从当前技术发展的趋势来看，在快速制氢上还没有真正可以商业化方面的新进展。
值得注意的是，加氢站高昂的建设成本，也决定了其在短时间之内难以大规模地铺开。加氢站加氢需要用到加氢枪，加氢枪的生产需要使用一定量的白金，成本极高。有数据显示，一座加氢气站的建设费用刨去政府补贴后，也仍需上千万元。
对于日本政府大力推广氢燃料电池的做法，我认为一是为了未来的能源安全做技术上的储备，二是加氢站相关的配套产业非常庞大，对日本经济有很大的拉动作用。即使氢燃料电池的推广没有起到预期的效果，对日本的汽车产业也不会起到太大的影响。而氢燃料电池车在其他国家的开展，存在很大难度。